Без моего разрешения, прописали внучку после ее рождения, я об этом узнала, когда ей исполнилось 12 лет. как выписать?

Внучку можете снять с регистрации в судебном порядке, т. к. она не может проживать без родителей.
если вы уверены, что ваш сын квартиру в иркутске жене не подарил, она была в его собственности до конца жизни, а сейчас у внучки доли в этой квартире нет, то можете подгадить жизнь бывшей невестке. можете написать жалобу в органы опеки о том, что мать пренебрегла своими обязанностями и не приняла наследство за свою дочь, т. е. не включила её в число наследников.